107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1863 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  96.11 
 
 
180 aa  339  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  92.86 
 
 
182 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  92.22 
 
 
180 aa  328  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  91.85 
 
 
184 aa  328  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  90.27 
 
 
185 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  87.43 
 
 
180 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  83.23 
 
 
180 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  83.23 
 
 
180 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  83.23 
 
 
180 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  83.23 
 
 
180 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  83.23 
 
 
180 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  83.23 
 
 
180 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  82.63 
 
 
180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  71.67 
 
 
179 aa  254  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  69.01 
 
 
181 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  71.11 
 
 
179 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  58.52 
 
 
181 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  56.5 
 
 
194 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  56.67 
 
 
182 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  55.69 
 
 
191 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  50.86 
 
 
191 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  52.94 
 
 
164 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  50.87 
 
 
165 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  50.59 
 
 
165 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  51.76 
 
 
164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  48.31 
 
 
184 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  47.95 
 
 
164 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  47.95 
 
 
164 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  47.95 
 
 
164 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  48.54 
 
 
164 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  44.44 
 
 
169 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  48.84 
 
 
165 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  46.55 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  49.71 
 
 
168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  42.94 
 
 
165 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  40.51 
 
 
208 aa  140  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  61.11 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  44.85 
 
 
159 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  61.11 
 
 
162 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  41.84 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  42.76 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  37.95 
 
 
161 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  41.4 
 
 
200 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  42.44 
 
 
167 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  35.67 
 
 
158 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  44.36 
 
 
168 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  40.65 
 
 
182 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  52.38 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  41.18 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  47.54 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  45.76 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  43.14 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  45.19 
 
 
127 aa  92  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  35.67 
 
 
178 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  90.9  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  49.5 
 
 
141 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  45.45 
 
 
148 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  41.83 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  37.14 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3273  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.715053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  42.45 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  52.56 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  40.68 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  46.67 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  41.22 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  42.06 
 
 
141 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5828  hypothetical protein  41.59 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.49354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  43.43 
 
 
132 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1928  hypothetical protein  44.09 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.320928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1794  hypothetical protein  44.09 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  44 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  42.31 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  41.58 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  39.05 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  49.35 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  38.3 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  48.05 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  43.27 
 
 
144 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  40.59 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1760  hypothetical protein  47.37 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328294  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  41.57 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  48.05 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  48.61 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1395  hypothetical protein  34 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1151  hypothetical protein  42.11 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3053  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.728603  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  34.51 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1567  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0629  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1434  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1465  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>