107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2014 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  339  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  43.27 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  42.94 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  42.94 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  42.69 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  42.11 
 
 		 182 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  40.35 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  41.92 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  41.07 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  41.07 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  41.07 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  41.07 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  40.61 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  44.05 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  40.12 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  40.48 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  39.88 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  41.07 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  38.32 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  36.75 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  35.54 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  36.47 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  37.65 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  37.06 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  34.73 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  37.2 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  36.75 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  37.13 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  36.99 
 
 		 194 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  36.42 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  36.99 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  36.69 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  45.37 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  45.37 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  31.61 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  33.11 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  32.85 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  42.7 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  32.73 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  31.13 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  39.22 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  31.29 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  43.21 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  39.82 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  45.35 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  36.97 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  30.57 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  42.7 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  32.05 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  42.5 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1395  hypothetical protein  36.13 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3273  hypothetical protein  45.07 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  33.64 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  32.74 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  40.38 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  38.53 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  31.79 
 
 		 200 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  34.17 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  36.63 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1794  hypothetical protein  40.45 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  30.08 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1928  hypothetical protein  40.45 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.320928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1265  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.229462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  42.86 
 
 		 374 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  27.34 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  29.09 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  31.73 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  29.71 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  28.99 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  32.08 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  32.82 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  46.3 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1760  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3053  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.728603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1567  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  47.83 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0629  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1434  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1465  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  32.35 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  31.13 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1151  hypothetical protein  35.4 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  30.48 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  28.15 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  32.61 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>