107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1102 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  64.46 
 
 		 168 aa  236  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  65.85 
 
 		 170 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  64.63 
 
 		 170 aa  223  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  44.91 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  42.26 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  41.67 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  41.67 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  42.96 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  36.62 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  48.04 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  38.51 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  47.06 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  60 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  45.53 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  47.25 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  50.51 
 
 		 141 aa  87.8  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  50.59 
 
 		 185 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  41.03 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  51.95 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  52.27 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  41.8 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  47.22 
 
 		 194 aa  84  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  48.05 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  48.05 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  50.62 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  30.86 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  48.05 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  47.96 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  48.05 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  52.63 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  51.9 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  36.81 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  40.97 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  44.95 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  44.95 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  41.13 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  48.05 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  46.84 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  37.86 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  33.78 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  36.94 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  34.64 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  46.67 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  46.67 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  42.99 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  42.72 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  37.69 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  48.24 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  51.28 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  47.06 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  47.5 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  37.21 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  46.75 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  51.47 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  34.11 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  39.67 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  44.79 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  37.76 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  45.24 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  42.45 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  37.38 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  36.63 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  52.86 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  58.49 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  52.63 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  44.79 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0336  hypothetical protein  35.82 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  39.45 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  41.51 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1940  hypothetical protein  40.96 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0591  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  56.6 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4394  hypothetical protein  59.18 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  0.0572179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1771  hypothetical protein  39.76 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5828  hypothetical protein  46.05 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  48.15 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1395  hypothetical protein  39.18 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1151  hypothetical protein  40.4 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  41.86 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3053  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.728603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1567  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  36 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0629  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1434  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1465  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>