107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2729 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  97.56 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  89.63 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  86.59 
 
 		 164 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  85.37 
 
 		 164 aa  300  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  85.37 
 
 		 164 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  85.37 
 
 		 164 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  76.22 
 
 		 165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  73.17 
 
 		 165 aa  258  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  71.34 
 
 		 165 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  70.12 
 
 		 165 aa  251  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  53.53 
 
 		 185 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  55.95 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  55.95 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  55.95 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  55.95 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  55.95 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  55.95 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  54.49 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  55.36 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  52.94 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  52.94 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  52.94 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  51.76 
 
 		 184 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  51.18 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  48.82 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  49.41 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  49.71 
 
 		 194 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  46.63 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  48.47 
 
 		 191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  49.71 
 
 		 181 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  49.13 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  44.64 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  46.63 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  46.88 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  50.96 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  44.12 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  47.33 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  46.3 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  40.61 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  43.14 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  55.75 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  53.85 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  46.62 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  39.39 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  45.52 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  43.55 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  35.98 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  97.1  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  34.78 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  95.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  37.27 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  54.35 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  45.28 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  39.72 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  47.06 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  56.47 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  41.28 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  35.86 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  87.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  32.92 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  41.28 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  58.44 
 
 		 135 aa  84.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  50.65 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  45.98 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  30.63 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  47.12 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5828  hypothetical protein  51.14 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  45.98 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  43.88 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  41.53 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  34.87 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  43.93 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  33.8 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1794  hypothetical protein  48.31 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1928  hypothetical protein  48.31 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.320928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  53.75 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  43.24 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  41.44 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  47.44 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  47.67 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  40.54 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  42.5 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  30.46 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3053  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.728603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1567  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0629  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1434  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1465  hypothetical protein  41.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  33.63 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4394  hypothetical protein  51.43 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  0.0572179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3273  hypothetical protein  40.79 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.89 
 
 		 374 aa  67.8  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  45.12 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1395  hypothetical protein  34.51 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1940  hypothetical protein  38.75 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>