99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0998 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.132286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1087  hypothetical protein  68.38 
 
 		 117 aa  162  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1856  hypothetical protein DUF498  63.25 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239949  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0458  hypothetical protein  62.39 
 
 		 117 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261968  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1800  hypothetical protein  61.54 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0446  hypothetical protein  61.54 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1414  hypothetical protein  60 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919833  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2493  hypothetical protein  43.09 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.688311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2190  protein of unknown function DUF498  44.14 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1762  hypothetical protein  41.12 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4226  hypothetical protein  43.24 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4596  protein of unknown function DUF498  43.24 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4745  protein of unknown function DUF498  42.34 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0214225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1795  hypothetical protein  40.18 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4311  hypothetical protein  38.46 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1497  protein of unknown function DUF498  36.61 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5221  hypothetical protein  41.59 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2278  hypothetical protein  39.64 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1695  protein of unknown function DUF498  34.82 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3038  hypothetical protein  36.04 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2661  hypothetical protein  39.29 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0471  hypothetical protein  41.28 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0631  protein of unknown function DUF498  41.28 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2857  protein of unknown function DUF498  38.39 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1175  hypothetical protein  36.51 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0610341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3106  hypothetical protein  37.84 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575793  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2657  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2335  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1829  protein of unknown function DUF498  38.26 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1824  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0888  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1801  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1003  hypothetical protein  38.39 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1968  hypothetical protein  35.58 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0922957  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0892  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150863  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1910  hypothetical protein  36.11 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0442  protein of unknown function DUF498  35.48 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.268607 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0515  hypothetical protein  27.5 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.25915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1253  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2027  hypothetical protein  48.48 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.977689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1325  hypothetical protein  36.29 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.601911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2388  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1236  hypothetical protein  36.28 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0436  hypothetical protein  34.15 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1767  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.119817  hitchhiker  0.00949574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2561  protein of unknown function DUF498  36.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3208  hypothetical protein  36.61 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1417  hypothetical protein  36.7 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313005  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0516  hypothetical protein  26.67 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1856  hypothetical protein  35.78 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6223  hypothetical protein  35.78 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1880  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  hitchhiker  0.00000967004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2774  hypothetical protein  30.36 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.274948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1437  hypothetical protein  33.03 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2234  hypothetical protein  31.97 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1766  hypothetical protein  34.26 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45072  normal  0.274512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5157  hypothetical protein  35.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1794  hypothetical protein  34.26 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2272  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2398  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0929  hypothetical protein  31.48 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2196  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000028663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3170  protein of unknown function DUF498  29.73 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0438826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1283  protein of unknown function DUF498  47.37 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.667566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1464  protein of unknown function DUF498  46.97 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1149  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0020  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1877  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2775  hypothetical protein  30.63 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648943  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2730  hypothetical protein  29.73 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117321  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1995  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0077  hypothetical protein  44.12 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0065  hypothetical protein  44.12 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.983005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0127  hypothetical protein  33.96 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2188  hypothetical protein  33.62 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1553  hypothetical protein  46.38 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0902  hypothetical protein  28.93 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1046  hypothetical protein  28.93 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0924  hypothetical membrane spanning protein  31.82 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2383  hypothetical protein  44.64 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0893854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1804  protein of unknown function DUF498  44.64 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.815377  hitchhiker  0.00157718 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02020  hypothetical protein  36.05 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1455  hypothetical protein  32.43 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0182  hypothetical protein  36.99 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0107793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0841  hypothetical protein  43.1 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.479517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0361  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.457424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0891  protein of unknown function DUF498  42.86 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1261  protein of unknown function DUF498  35.45 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2233  hypothetical protein  31.9 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177342  hitchhiker  0.000000240979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2580  protein of unknown function DUF498  34.88 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1200  protein of unknown function DUF498  34.55 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0224594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00161  hypothetical protein  49.06 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1570  hypothetical protein  27.72 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1414  hypothetical protein  27.72 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1298  protein of unknown function DUF498  27.78 
 
 		 113 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92430  predicted protein  29.46 
 
 		 119 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>