86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2774 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.274948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4404  hypothetical protein  72.13 
 
 		 127 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150863  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3170  protein of unknown function DUF498  72.88 
 
 		 127 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0438826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2775  hypothetical protein  67.72 
 
 		 127 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648943  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2730  hypothetical protein  69.49 
 
 		 127 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117321  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1801  hypothetical protein  62.99 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1767  hypothetical protein  61.42 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.119817  hitchhiker  0.00949574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1497  protein of unknown function DUF498  48.31 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1695  protein of unknown function DUF498  49.15 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1175  hypothetical protein  48.31 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0610341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4596  protein of unknown function DUF498  51.28 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4226  hypothetical protein  51.28 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2493  hypothetical protein  52.54 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.688311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2190  protein of unknown function DUF498  55.46 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2335  hypothetical protein  47.46 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2278  hypothetical protein  46.97 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0888  hypothetical protein  47.46 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0892  hypothetical protein  47.46 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4745  protein of unknown function DUF498  50.43 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0214225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1795  hypothetical protein  44.92 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2657  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2857  protein of unknown function DUF498  44.88 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0525  hypothetical protein  39.83 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1003  hypothetical protein  46.61 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4311  hypothetical protein  40.17 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3038  hypothetical protein  43.36 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1762  hypothetical protein  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3106  hypothetical protein  35.14 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575793  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1087  hypothetical protein  30.58 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132055 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0516  hypothetical protein  30.97 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2388  hypothetical protein  31.75 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2383  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1804  protein of unknown function DUF498  33.87 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.815377  hitchhiker  0.00157718 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0515  hypothetical protein  31.36 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.25915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919833  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1856  hypothetical protein DUF498  31.25 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239949  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1046  hypothetical protein  33.61 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0902  hypothetical protein  33.61 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0998  hypothetical protein  30.36 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.132286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1968  hypothetical protein  28.18 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0922957  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1325  hypothetical protein  31.5 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.601911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0361  hypothetical protein  32.14 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.457424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0458  hypothetical protein  29.46 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261968  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1200  protein of unknown function DUF498  33.04 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0224594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0929  hypothetical protein  33.04 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1995  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1553  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1261  protein of unknown function DUF498  30.47 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1283  protein of unknown function DUF498  30.7 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.667566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1824  hypothetical protein  33.04 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1437  hypothetical protein  28.91 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1794  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0631  protein of unknown function DUF498  31.97 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0471  hypothetical protein  31.97 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1766  hypothetical protein  34.02 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45072  normal  0.274512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2196  hypothetical protein  26.98 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000028663  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33214  predicted protein  27.66 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00161  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1417  hypothetical protein  34.02 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313005  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1253  hypothetical protein  29.79 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1880  hypothetical protein  32.99 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  hitchhiker  0.00000967004 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92430  predicted protein  27.52 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0436  hypothetical protein  29.09 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0182  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0107793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1877  hypothetical protein  26.19 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6223  hypothetical protein  32.99 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5157  hypothetical protein  32.99 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1856  hypothetical protein  32.99 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0020  hypothetical protein  26.19 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0077  hypothetical protein  31.91 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2234  hypothetical protein  26.19 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1149  hypothetical protein  26.19 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2398  hypothetical protein  26.19 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2272  hypothetical protein  26.19 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1464  protein of unknown function DUF498  33.33 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0065  hypothetical protein  32.98 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.983005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0841  hypothetical protein  38.6 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.479517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0891  protein of unknown function DUF498  38.46 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1455  hypothetical protein  25.62 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0924  hypothetical membrane spanning protein  31.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2233  hypothetical protein  38.1 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177342  hitchhiker  0.000000240979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2027  hypothetical protein  34.94 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.977689 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1091  hypothetical protein  31.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0893854  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02020  hypothetical protein  37.29 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>