96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0442 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0442  protein of unknown function DUF498  100 
 
 
125 aa  259  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.268607 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0436  hypothetical protein  86.29 
 
 
125 aa  228  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1325  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.601911  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1995  hypothetical protein  46.77 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1804  protein of unknown function DUF498  46.34 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.815377  hitchhiker  0.00157718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1880  hypothetical protein  46.34 
 
 
124 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  hitchhiker  0.00000967004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1766  hypothetical protein  45.53 
 
 
163 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45072  normal  0.274512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1794  hypothetical protein  45.53 
 
 
171 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6223  hypothetical protein  45.53 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1968  hypothetical protein  48.39 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0922957  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1856  hypothetical protein  45.53 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2383  hypothetical protein  47.15 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1200  protein of unknown function DUF498  48.39 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0224594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0929  hypothetical protein  44.72 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5157  hypothetical protein  45.53 
 
 
165 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1236  hypothetical protein  46.77 
 
 
125 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1829  protein of unknown function DUF498  50 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2234  hypothetical protein  44.72 
 
 
124 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1417  hypothetical protein  44.72 
 
 
170 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313005  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1877  hypothetical protein  44.72 
 
 
124 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1149  hypothetical protein  44.72 
 
 
124 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0020  hypothetical protein  44.72 
 
 
124 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2272  hypothetical protein  43.9 
 
 
173 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1539  hypothetical protein  46.77 
 
 
125 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.852549  normal  0.715984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1261  protein of unknown function DUF498  47.5 
 
 
135 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323599  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2196  hypothetical protein  44.72 
 
 
173 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000028663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2398  hypothetical protein  43.9 
 
 
173 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2661  hypothetical protein  47.54 
 
 
121 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2027  hypothetical protein  44.72 
 
 
123 aa  120  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.977689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2580  protein of unknown function DUF498  47.62 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1046  hypothetical protein  47.54 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.737  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0902  hypothetical protein  47.54 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1553  hypothetical protein  45.08 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2188  hypothetical protein  46.46 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961355  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5221  hypothetical protein  43.9 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2561  protein of unknown function DUF498  42.28 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3208  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2233  hypothetical protein  44.53 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177342  hitchhiker  0.000000240979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0182  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0107793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1910  hypothetical protein  43.09 
 
 
124 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2388  hypothetical protein  42.28 
 
 
138 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1824  hypothetical protein  39.34 
 
 
124 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1437  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0127  hypothetical protein  39.02 
 
 
123 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0841  hypothetical protein  41.94 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.479517  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1283  protein of unknown function DUF498  40 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.667566  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1253  hypothetical protein  38.52 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0798648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0471  hypothetical protein  40.5 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0631  protein of unknown function DUF498  40.5 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1091  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0893854  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0924  hypothetical membrane spanning protein  33.94 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1464  protein of unknown function DUF498  32.52 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00161  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0065  hypothetical protein  33.98 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.983005  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0077  hypothetical protein  34.31 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1762  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0458  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261968  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1087  hypothetical protein  32.52 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.132055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1455  hypothetical protein  31.58 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0446  hypothetical protein  37.1 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1800  hypothetical protein  37.1 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1856  hypothetical protein DUF498  33.33 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239949  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1570  hypothetical protein  31.86 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1414  hypothetical protein  31.86 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0516  hypothetical protein  32.74 
 
 
120 aa  60.8  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0891  protein of unknown function DUF498  27.64 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0998  hypothetical protein  35.48 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.132286  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1767  hypothetical protein  32.74 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.119817  hitchhiker  0.00949574 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0515  hypothetical protein  37.72 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.25915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2857  protein of unknown function DUF498  37.29 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4745  protein of unknown function DUF498  33.9 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0214225 
 
 
-
 
NC_002978  WD0361  hypothetical protein  29.2 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.457424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3106  hypothetical protein  36.25 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575793  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02020  hypothetical protein  41.56 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2657  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4596  protein of unknown function DUF498  32.46 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1414  hypothetical protein  28.32 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919833  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1801  hypothetical protein  30.97 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4226  hypothetical protein  32.46 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2493  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.688311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4311  hypothetical protein  34.82 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2190  protein of unknown function DUF498  34.21 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1795  hypothetical protein  35.34 
 
 
129 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1175  hypothetical protein  33.91 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0610341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4404  hypothetical protein  27.19 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150863  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2278  hypothetical protein  46.43 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3038  hypothetical protein  25.44 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2775  hypothetical protein  32.18 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648943  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1695  protein of unknown function DUF498  28.95 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1497  protein of unknown function DUF498  30.43 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1298  protein of unknown function DUF498  28.7 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92430  predicted protein  28.42 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2730  hypothetical protein  38.98 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117321  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2335  hypothetical protein  28.07 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3170  protein of unknown function DUF498  25 
 
 
127 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0438826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1003  hypothetical protein  31.93 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>