86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1829 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1829  protein of unknown function DUF498  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1236  hypothetical protein  70.73 
 
 		 125 aa  190  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3208  hypothetical protein  65.57 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2561  protein of unknown function DUF498  65.57 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2188  hypothetical protein  64.29 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2233  hypothetical protein  65.35 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177342  hitchhiker  0.000000240979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1910  hypothetical protein  60.48 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2661  hypothetical protein  64.46 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5221  hypothetical protein  63.11 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1539  hypothetical protein  56 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.852549  normal  0.715984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1766  hypothetical protein  54.47 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45072  normal  0.274512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1794  hypothetical protein  54.47 
 
 		 171 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1325  hypothetical protein  53.23 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.601911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1880  hypothetical protein  54.47 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  hitchhiker  0.00000967004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0929  hypothetical protein  53.66 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1856  hypothetical protein  53.66 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6223  hypothetical protein  53.66 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5157  hypothetical protein  53.66 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0442  protein of unknown function DUF498  50 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.268607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1417  hypothetical protein  52.85 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313005  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1200  protein of unknown function DUF498  49.19 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0224594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1261  protein of unknown function DUF498  48.39 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1877  hypothetical protein  52.03 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0020  hypothetical protein  52.03 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1149  hypothetical protein  52.03 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2234  hypothetical protein  52.03 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2398  hypothetical protein  51.22 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2272  hypothetical protein  51.22 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1804  protein of unknown function DUF498  50.41 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.815377  hitchhiker  0.00157718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2196  hypothetical protein  52.03 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000028663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0436  hypothetical protein  46.77 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2383  hypothetical protein  50.41 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1995  hypothetical protein  46.77 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2027  hypothetical protein  46.34 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.977689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1968  hypothetical protein  45.16 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0922957  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1553  hypothetical protein  43.12 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0841  hypothetical protein  42.74 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.479517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2388  hypothetical protein  38.14 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0902  hypothetical protein  42.62 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1046  hypothetical protein  42.62 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0924  hypothetical membrane spanning protein  42.2 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1091  hypothetical protein  42.2 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0893854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2580  protein of unknown function DUF498  42.86 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0182  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0107793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1824  hypothetical protein  37.7 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1253  hypothetical protein  34.21 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0798648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0127  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0631  protein of unknown function DUF498  37.6 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0471  hypothetical protein  37.6 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1437  hypothetical protein  38.53 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1283  protein of unknown function DUF498  35.45 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.667566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0998  hypothetical protein  38.26 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.132286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1464  protein of unknown function DUF498  31.71 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1762  hypothetical protein  39.09 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0077  hypothetical protein  31.31 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0065  hypothetical protein  31.31 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.983005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1856  hypothetical protein DUF498  32.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239949  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0458  hypothetical protein  33.88 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261968  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1087  hypothetical protein  32.17 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00161  hypothetical protein  28.28 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1800  hypothetical protein  36.89 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0446  hypothetical protein  36.89 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4745  protein of unknown function DUF498  37.39 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0214225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3038  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1455  hypothetical protein  34.15 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1414  hypothetical protein  24.17 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0516  hypothetical protein  28.32 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1570  hypothetical protein  24.17 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0515  hypothetical protein  30.58 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.25915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575793  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4596  protein of unknown function DUF498  48.28 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4226  hypothetical protein  48.28 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2190  protein of unknown function DUF498  46.43 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1414  hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919833  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1795  hypothetical protein  34.23 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1767  hypothetical protein  29.82 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.119817  hitchhiker  0.00949574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2493  hypothetical protein  44.64 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.688311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1497  protein of unknown function DUF498  35 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_002978  WD0361  hypothetical protein  25.41 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.457424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1175  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0610341 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92430  predicted protein  35 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2278  hypothetical protein  42.42 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1801  hypothetical protein  27.13 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0891  protein of unknown function DUF498  34.21 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1695  protein of unknown function DUF498  30.63 
 
 		 128 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2775  hypothetical protein  28.33 
 
 		 127 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648943  normal  0.66012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>