62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1361 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1361  Abortive infection protein  100 
 
 
192 aa  370  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.211938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  43.33 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  39.09 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  43.9 
 
 
315 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1193  abortive infection protein  29.44 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  33.33 
 
 
312 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  43.33 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  43.33 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  41.77 
 
 
251 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  35.56 
 
 
257 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  38.27 
 
 
538 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  34.26 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  30.97 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  39.02 
 
 
396 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0966  immunity protein PlnI  31.58 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0817583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  39.24 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  31.72 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  31.71 
 
 
289 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  37.76 
 
 
193 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  30.34 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  31.72 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  31.72 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26075  predicted protein  32.04 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  35.71 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  38.2 
 
 
362 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  29.63 
 
 
528 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  30.34 
 
 
288 aa  45.1  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  33 
 
 
201 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  38.27 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  25.95 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  40 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  31.94 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  40.66 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  29.93 
 
 
269 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  35.14 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  31.25 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  35.14 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  30.89 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  33.78 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  33.04 
 
 
242 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  33.33 
 
 
286 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  31 
 
 
297 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  36.71 
 
 
276 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  34.25 
 
 
291 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  32.26 
 
 
374 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  40 
 
 
195 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  38.82 
 
 
285 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  38.96 
 
 
480 aa  41.6  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  37.35 
 
 
321 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  29.67 
 
 
317 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2288  Abortive infection protein  39.39 
 
 
241 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  30.59 
 
 
311 aa  41.2  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  35.71 
 
 
276 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  28.4 
 
 
246 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  35.44 
 
 
527 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  35.44 
 
 
527 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>