33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1193 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1193  abortive infection protein  100 
 
 
203 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2452  hypothetical protein  46.53 
 
 
135 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0753878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  35.26 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  36.79 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26075  predicted protein  31.11 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  31.43 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  38.46 
 
 
312 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1361  Abortive infection protein  29.44 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.211938 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  35.87 
 
 
315 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.79 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  30.07 
 
 
255 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  33.65 
 
 
308 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  29.35 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  32.14 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  35.11 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  37 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  32.11 
 
 
254 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  32.11 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  33.33 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  36.96 
 
 
262 aa  45.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  31.68 
 
 
237 aa  45.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  32.97 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  30.52 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  35.64 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  33.7 
 
 
194 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  30.99 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  30.99 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  32.58 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  39.78 
 
 
120 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  34.04 
 
 
311 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1088  abortive infection protein  31.82 
 
 
322 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  37.35 
 
 
299 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  27.59 
 
 
286 aa  41.2  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>