42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1135 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  100 
 
 		 180 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  33.33 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  34.03 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  34.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  32.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  30.99 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  30.99 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1685  Abortive infection protein  34.39 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  29.5 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1506  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0652668 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  31.01 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  31.15 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  30.23 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  28.26 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  35.29 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  38.37 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2683  Abortive infection protein  37.36 
 
 		 285 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0434627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  35.42 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  30.77 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  37.36 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  35.56 
 
 		 242 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  26.35 
 
 		 338 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  32.91 
 
 		 246 aa  44.3  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  44.3  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  32.95 
 
 		 374 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.33 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  35 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  31.82 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  32.84 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0437  Abortive infection protein  32.47 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4135  Abortive infection protein  28.68 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  30.3 
 
 		 251 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2288  Abortive infection protein  33.1 
 
 		 241 aa  41.2  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  26.27 
 
 		 286 aa  41.2  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>