199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0380 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0380  Trk family sodium transporter  100 
 
 
471 aa  922    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2313  Trk family sodium transporter  82.8 
 
 
471 aa  711    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.262047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02551  putative sodium transporter, Trk family  73.67 
 
 
467 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1448  putative sodium transporter, Trk family  65.87 
 
 
461 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.225676  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01501  Trk family sodium transporter  65.87 
 
 
461 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00931  Trk family sodium transporter  68.15 
 
 
467 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00941  Trk family sodium transporter  62.85 
 
 
467 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0087  Trk family sodium transporter  62.42 
 
 
467 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.272527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00971  Trk family sodium transporter  62.42 
 
 
467 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00961  Trk family sodium transporter  62.42 
 
 
467 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.419484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  37.5 
 
 
443 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  36.68 
 
 
446 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  38.49 
 
 
443 aa  256  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  34.72 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  34.72 
 
 
447 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  33.98 
 
 
447 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  33.98 
 
 
447 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  33.76 
 
 
447 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  33.76 
 
 
447 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  33.76 
 
 
447 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  33.76 
 
 
447 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  33.55 
 
 
447 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  34.77 
 
 
447 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  34.26 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  36.18 
 
 
441 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  39.83 
 
 
447 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  38.55 
 
 
453 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  36.66 
 
 
449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  35.34 
 
 
446 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  38.51 
 
 
454 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  38.51 
 
 
454 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  38.72 
 
 
422 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.5 
 
 
633 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.42 
 
 
456 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.83 
 
 
584 aa  231  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  35.13 
 
 
445 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  38.23 
 
 
444 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  38.19 
 
 
443 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  36.24 
 
 
445 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  35.27 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  35.19 
 
 
454 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  35.19 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  32.29 
 
 
451 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  35 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  38.44 
 
 
457 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  38.46 
 
 
443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  35.24 
 
 
453 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  37.27 
 
 
457 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  34.71 
 
 
444 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  37.53 
 
 
443 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.89 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  34.3 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  34.76 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  34.65 
 
 
453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  34.91 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  34.42 
 
 
453 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.41 
 
 
448 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.17 
 
 
447 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  32.77 
 
 
458 aa  209  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  37.59 
 
 
449 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  35.05 
 
 
453 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  33.05 
 
 
586 aa  207  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.67 
 
 
457 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1794  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.53 
 
 
453 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  32.75 
 
 
439 aa  206  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.18 
 
 
453 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.89 
 
 
616 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  33.05 
 
 
586 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  32.47 
 
 
439 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  36.17 
 
 
443 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  37.88 
 
 
446 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  38.75 
 
 
443 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.48 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  34.56 
 
 
454 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.89 
 
 
454 aa  200  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.16 
 
 
458 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  31.87 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  32.2 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  34.3 
 
 
450 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.12 
 
 
435 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.12 
 
 
435 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  34.47 
 
 
454 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  32.1 
 
 
439 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  31.17 
 
 
442 aa  195  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  30.85 
 
 
454 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  32.1 
 
 
439 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  32.1 
 
 
439 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  32.4 
 
 
446 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  32.1 
 
 
439 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  32.18 
 
 
446 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  31.45 
 
 
439 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  33.49 
 
 
455 aa  193  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  34.09 
 
 
458 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  32.58 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  31.89 
 
 
439 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  32.32 
 
 
439 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.15 
 
 
430 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  38.69 
 
 
474 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  31.45 
 
 
439 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2088  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.13 
 
 
453 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>