213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1558 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 447 aa  899    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  48.07 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  40.54 
 
 		 446 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  40.54 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  39.6 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  39.73 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  41.2 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  39.45 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  38.95 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  38.5 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  38.14 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.67 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  37.76 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  37.53 
 
 		 447 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  35.9 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  37.53 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  37.99 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  37.33 
 
 		 450 aa  279  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  37.07 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  37.07 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  36.61 
 
 		 447 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  37.3 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  37.3 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  37.3 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 		 447 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  36.55 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  35.96 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  37.95 
 
 		 443 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  34.8 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.86 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  36.02 
 
 		 458 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  38.48 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.94 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  35.94 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.28 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  36.61 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  38.53 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.94 
 
 		 456 aa  240  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  31.96 
 
 		 443 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.48 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  36.9 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.81 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  35.71 
 
 		 444 aa  232  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  34.1 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  34.1 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  34.02 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  34.32 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  35.63 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  34.1 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  34.25 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  34.25 
 
 		 453 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.4 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  33.64 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.88 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  33.87 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  34.36 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  34.36 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.09 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  37.05 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  34.07 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.84 
 
 		 453 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  31.93 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.97 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  35.21 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.78 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.78 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.31 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  34.25 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  34.52 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  34.7 
 
 		 439 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  34.25 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  34.38 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  35.36 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  34.02 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  33.41 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2088  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  34.02 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0953  potassium uptake protein, TrkH family  34.42 
 
 		 442 aa  217  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  34.02 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  34.02 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.51 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  33.11 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  35.4 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  34.78 
 
 		 458 aa  216  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.63 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  32.74 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.04 
 
 		 616 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  31.64 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  34.23 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  35.06 
 
 		 443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.26 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  33.79 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.26 
 
 		 633 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.48 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0727  potassium uptake protein, TrkH family  35 
 
 		 429 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.157517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  36.01 
 
 		 453 aa  213  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0351  Trk-type K+ transport system, membrane component  32.68 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  32 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>