204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2143 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
446 aa  875    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  99.1 
 
 
446 aa  868    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  52.14 
 
 
447 aa  441  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  47.86 
 
 
446 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  47.26 
 
 
445 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  47.93 
 
 
446 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  47.03 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  49.43 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  48.51 
 
 
441 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  46.17 
 
 
443 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  47.17 
 
 
447 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.93 
 
 
455 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  44.12 
 
 
450 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  42.13 
 
 
451 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  45.17 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.54 
 
 
447 aa  354  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  46.64 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.93 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  43.31 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  42.47 
 
 
447 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  40.73 
 
 
443 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  41.95 
 
 
447 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  42.18 
 
 
447 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  40.32 
 
 
458 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  42.47 
 
 
447 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  42.47 
 
 
447 aa  329  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  42.47 
 
 
447 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  42.47 
 
 
447 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  42.47 
 
 
447 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  41.72 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  42.01 
 
 
447 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  39.23 
 
 
467 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  43.4 
 
 
456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  41.81 
 
 
458 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.38 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.98 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  42.27 
 
 
443 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 
441 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  41.31 
 
 
444 aa  309  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  42.5 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  39.9 
 
 
422 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  39.74 
 
 
457 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  41 
 
 
439 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  40.77 
 
 
439 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  40.55 
 
 
439 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  40.55 
 
 
439 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  40.55 
 
 
439 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  40.55 
 
 
439 aa  299  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  40.55 
 
 
439 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  41.23 
 
 
439 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  40.32 
 
 
439 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.69 
 
 
442 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  40.32 
 
 
439 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  40.81 
 
 
457 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  37.56 
 
 
455 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  41.27 
 
 
420 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  40.18 
 
 
454 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.15 
 
 
446 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.61 
 
 
454 aa  292  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  38.72 
 
 
453 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  39.37 
 
 
447 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  38.81 
 
 
455 aa  289  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  36.51 
 
 
432 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.75 
 
 
435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.75 
 
 
435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  36.57 
 
 
449 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.26 
 
 
616 aa  286  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  37.92 
 
 
454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  39.32 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  39.15 
 
 
453 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  39.25 
 
 
454 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  39.25 
 
 
454 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  38.24 
 
 
447 aa  280  3e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  37.53 
 
 
444 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  37.86 
 
 
443 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.26 
 
 
449 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.27 
 
 
633 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  39.95 
 
 
471 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  38.75 
 
 
454 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  39.03 
 
 
454 aa  275  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  38.28 
 
 
454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  41.69 
 
 
474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.24 
 
 
452 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  38.15 
 
 
453 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  38.57 
 
 
453 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  38.34 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0953  potassium uptake protein, TrkH family  42.65 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  37.92 
 
 
453 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  35.32 
 
 
586 aa  269  8.999999999999999e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  37.25 
 
 
454 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  37.5 
 
 
458 aa  266  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.54 
 
 
444 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0351  Trk-type K+ transport system, membrane component  38.93 
 
 
454 aa  265  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.48 
 
 
443 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  34.88 
 
 
586 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  38.03 
 
 
455 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.92 
 
 
442 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.93 
 
 
456 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  38.8 
 
 
453 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  36.61 
 
 
445 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>