213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0215 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  100 
 
 
443 aa  867    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.78 
 
 
442 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.09 
 
 
444 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  56.06 
 
 
443 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  54 
 
 
444 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.65 
 
 
454 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.23 
 
 
452 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.23 
 
 
449 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.4 
 
 
444 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.17 
 
 
444 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.11 
 
 
460 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.77 
 
 
446 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  49.21 
 
 
464 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  48.6 
 
 
432 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  47.92 
 
 
431 aa  359  6e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.16 
 
 
473 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.77 
 
 
443 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  46.91 
 
 
458 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.63 
 
 
461 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  41.31 
 
 
446 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  46.68 
 
 
469 aa  333  5e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.08 
 
 
452 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.19 
 
 
479 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.05 
 
 
457 aa  330  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  42.83 
 
 
445 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  41.43 
 
 
446 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.58 
 
 
456 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.9 
 
 
458 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.17 
 
 
450 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  44.87 
 
 
477 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  42.14 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.74 
 
 
477 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  43.08 
 
 
447 aa  310  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  39.95 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  41.7 
 
 
444 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  42.27 
 
 
443 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  43.02 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  37.53 
 
 
447 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  41.08 
 
 
471 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  37.3 
 
 
447 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  36.84 
 
 
447 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  40.72 
 
 
456 aa  276  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  36.84 
 
 
447 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  37.07 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  37.07 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  37.87 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  40.77 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  37.07 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  37.07 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  37.07 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  36.61 
 
 
447 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 
447 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  41.88 
 
 
447 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  39.23 
 
 
443 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  38.81 
 
 
441 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  35.54 
 
 
446 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  35.31 
 
 
446 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  38.91 
 
 
458 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  37.81 
 
 
450 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.94 
 
 
633 aa  262  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.86 
 
 
447 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  38.82 
 
 
422 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.21 
 
 
616 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  37.84 
 
 
443 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  37.36 
 
 
446 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  35.2 
 
 
451 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.64 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  37.44 
 
 
454 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  37.44 
 
 
454 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  36.93 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  36.7 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  36.7 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.8 
 
 
417 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  37.92 
 
 
439 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  37.95 
 
 
443 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  36.95 
 
 
453 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  36.94 
 
 
444 aa  251  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  34.75 
 
 
447 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.69 
 
 
454 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  36.45 
 
 
467 aa  249  5e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.84 
 
 
454 aa  249  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  36.54 
 
 
586 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  36.26 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.92 
 
 
456 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.12 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  35.7 
 
 
442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  38.53 
 
 
454 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  36.11 
 
 
586 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  35.79 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  36.75 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  37.44 
 
 
449 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  36.12 
 
 
453 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.12 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  37.44 
 
 
447 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  37.16 
 
 
439 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  35.96 
 
 
449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  37.3 
 
 
455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  37.58 
 
 
445 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  36.61 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  36.12 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>