203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0087 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0087  Trk family sodium transporter  100 
 
 
467 aa  916    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.272527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00971  Trk family sodium transporter  95.29 
 
 
467 aa  790    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00941  Trk family sodium transporter  89.72 
 
 
467 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00961  Trk family sodium transporter  96.15 
 
 
467 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.419484  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02551  putative sodium transporter, Trk family  68.31 
 
 
467 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1448  putative sodium transporter, Trk family  68.93 
 
 
461 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.225676  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01501  Trk family sodium transporter  68.71 
 
 
461 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00931  Trk family sodium transporter  67.45 
 
 
467 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0380  Trk family sodium transporter  62.42 
 
 
471 aa  548  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2313  Trk family sodium transporter  62.63 
 
 
471 aa  548  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.262047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  37.14 
 
 
443 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  36.28 
 
 
447 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  35.15 
 
 
447 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  35.15 
 
 
447 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  34.93 
 
 
447 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  34.93 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  34.93 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  36.14 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  34.93 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  36.14 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  36.34 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  34.72 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  35.67 
 
 
447 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  36.78 
 
 
446 aa  250  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  35.37 
 
 
441 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  39.63 
 
 
422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  38.75 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  38.44 
 
 
447 aa  234  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  38.67 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  38.72 
 
 
443 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  35.63 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  33.55 
 
 
445 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  35.93 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.53 
 
 
447 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  37.44 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  37.44 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  35.38 
 
 
449 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  32.61 
 
 
445 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  33.26 
 
 
441 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 
447 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  36.38 
 
 
439 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  33.95 
 
 
458 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  33.48 
 
 
439 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  35.79 
 
 
449 aa  206  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.01 
 
 
584 aa  206  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.56 
 
 
456 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  31.6 
 
 
451 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  33.26 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  34.25 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  33.89 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  34.04 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.81 
 
 
448 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  35.24 
 
 
442 aa  201  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  33.72 
 
 
446 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.83 
 
 
442 aa  199  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  34.42 
 
 
450 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.41 
 
 
633 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  33.4 
 
 
454 aa  196  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  35.84 
 
 
439 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  35.62 
 
 
439 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  31.48 
 
 
586 aa  194  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  32.57 
 
 
458 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  35.18 
 
 
439 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.94 
 
 
454 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  31.52 
 
 
454 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  30.66 
 
 
586 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  33.55 
 
 
439 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  33.55 
 
 
439 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  33.33 
 
 
439 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  33.55 
 
 
439 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  31.32 
 
 
454 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.42 
 
 
453 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.02 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.02 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  33.55 
 
 
439 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.65 
 
 
453 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  34.71 
 
 
420 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  35.37 
 
 
443 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  31.78 
 
 
453 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 
439 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.57 
 
 
430 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  32.96 
 
 
453 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  34.68 
 
 
447 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  35.38 
 
 
455 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  33.64 
 
 
446 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  32.96 
 
 
453 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  33.64 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  31.67 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  33.58 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  31.99 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  32.57 
 
 
447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  33.48 
 
 
443 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.18 
 
 
455 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  32.81 
 
 
455 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1794  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.24 
 
 
453 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  34.28 
 
 
454 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  32.05 
 
 
454 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  32.69 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.42 
 
 
417 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2088  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.98 
 
 
453 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>