186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2088 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2088  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 453 aa  877    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  91.61 
 
 		 453 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3558  H(+)-transporting two-sector ATPase  65.55 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  41.07 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  38.36 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  37.81 
 
 		 446 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  38.02 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  38.33 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  37.84 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  33.64 
 
 		 441 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  34.79 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  35.02 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  38.33 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  34.33 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  37.16 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  34.56 
 
 		 447 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  34.56 
 
 		 447 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  34.56 
 
 		 447 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  37.81 
 
 		 446 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  34.33 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  34.33 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  34.33 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  34.33 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  34.33 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  37.67 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  35.54 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  35.63 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  35.4 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.02 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.86 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  37.89 
 
 		 449 aa  223  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  35.93 
 
 		 458 aa  222  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  35.33 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  35.41 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  36.11 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  35.75 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.74 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  35.48 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  35.7 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  35.71 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.17 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  36.26 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  35.58 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  35.58 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1234  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.67 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.81 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  35.51 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3973  sodium transporter family protein  37.13 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  33.7 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  34 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  35.46 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  36.49 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  32.97 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  33.78 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.35 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.35 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  33.64 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.99 
 
 		 633 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  35.94 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.53 
 
 		 457 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1045  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.92 
 
 		 449 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  36.85 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  39.02 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  35.14 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  34.74 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1432  sodium transporter family protein  38.13 
 
 		 449 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.1 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.57 
 
 		 584 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  39.61 
 
 		 453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  31.73 
 
 		 451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1473  sodium transporter family protein  38.13 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1408  sodium transporter family protein  37.9 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1210  cation transporter  37.9 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1212  cation transporter  37.9 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1371  sodium transporter family protein  37.9 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  32.87 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1233  sodium transporter family protein  37.67 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1333  sodium transporter family protein  37.67 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  33.11 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  33.03 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.57 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  33.49 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  33.03 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  33.25 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.11 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  31.17 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  33.41 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  33.03 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  37.64 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  35.57 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  32.79 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  32.79 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  32.79 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  32.79 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  32.46 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02551  putative sodium transporter, Trk family  36.03 
 
 		 467 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1082  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.87 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.268804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1104  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.87 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000257723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  31.64 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>