220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0057 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  100 
 
 		 453 aa  902    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  72.47 
 
 		 454 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  90.07 
 
 		 453 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  87.67 
 
 		 454 aa  806    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  79.96 
 
 		 454 aa  741    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  90.73 
 
 		 453 aa  808    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  93.6 
 
 		 453 aa  850    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  73.63 
 
 		 455 aa  666    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  93.38 
 
 		 453 aa  848    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  89.4 
 
 		 453 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  87.89 
 
 		 454 aa  808    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  90.09 
 
 		 454 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  47.33 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  47.56 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  45.19 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  46.51 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  46.06 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  46.06 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  46.05 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  45.6 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  45.83 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  47.69 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  46.17 
 
 		 439 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  45.24 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  44.78 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  44.55 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  45.01 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  44.55 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  44.55 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  44.55 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  47.22 
 
 		 453 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  44.32 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  43.85 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  44.52 
 
 		 420 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  44.85 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  42.64 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  43.82 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  42.23 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  44.62 
 
 		 443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  42.73 
 
 		 454 aa  322  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  41.94 
 
 		 443 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  43.15 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  41.74 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  39.49 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  39.03 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  43.58 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  39.77 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  40.95 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  39.26 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.07 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  40.05 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.24 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.78 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 		 443 aa  259  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  38.05 
 
 		 456 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  38.22 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  35.41 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  39.57 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  39.15 
 
 		 446 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  39.15 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.32 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.32 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  36.05 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  35.81 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.96 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  36.43 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  39.54 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  36.82 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  37.39 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.9 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  34.46 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1475  TrkH family potassium uptake protein  37.01 
 
 		 447 aa  236  8e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  36.26 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0441  TrkH family potassium uptake protein  37.01 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1300  TrkH family potassium uptake protein  37.01 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  36.09 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  35.43 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.51 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  40.71 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  37.16 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  35.86 
 
 		 444 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  34.94 
 
 		 574 aa  227  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.41 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.05 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  36.2 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  36.2 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  36.21 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.47 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0458  sodium transport family protein  38.26 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00291021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  33.57 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.94 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  35.79 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  32.48 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.42 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.61 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  33.26 
 
 		 467 aa  220  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>