277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0138 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  100 
 
 
474 aa  926    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  45.45 
 
 
457 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.57 
 
 
456 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  42.29 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  42.86 
 
 
444 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  42.16 
 
 
445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  44.69 
 
 
457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  40.71 
 
 
446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  44.95 
 
 
458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.76 
 
 
448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  41.09 
 
 
446 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  38.33 
 
 
451 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  38.15 
 
 
447 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  42.06 
 
 
449 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  40.09 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  40.35 
 
 
446 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  41.29 
 
 
453 aa  289  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  40.35 
 
 
446 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  38.91 
 
 
447 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  38.91 
 
 
447 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  38.91 
 
 
447 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  38.91 
 
 
447 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  38.91 
 
 
447 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  39.11 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  38.48 
 
 
447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  41.56 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  44.6 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  40.4 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  38.67 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  38.48 
 
 
447 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  38.67 
 
 
447 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  39.35 
 
 
467 aa  282  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  40.4 
 
 
453 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  40.4 
 
 
454 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  40.18 
 
 
454 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  40.04 
 
 
454 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.09 
 
 
453 aa  279  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  40.18 
 
 
453 aa  279  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  42.56 
 
 
443 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  41.81 
 
 
443 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  39.51 
 
 
453 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  38.94 
 
 
443 aa  277  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  38.58 
 
 
454 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  40 
 
 
586 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  40.65 
 
 
586 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  41.99 
 
 
443 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  38.77 
 
 
446 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  40.04 
 
 
455 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  38.26 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  39.71 
 
 
422 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  37.77 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  39.52 
 
 
453 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.73 
 
 
442 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  40.71 
 
 
455 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  38.41 
 
 
443 aa  266  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.92 
 
 
447 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  44.02 
 
 
453 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.9 
 
 
417 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.09 
 
 
633 aa  263  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.01 
 
 
454 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.81 
 
 
455 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  38.86 
 
 
442 aa  262  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  36.61 
 
 
454 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  39.86 
 
 
455 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  38.01 
 
 
454 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  38.39 
 
 
441 aa  259  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  39.15 
 
 
453 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  37.33 
 
 
439 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1794  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.25 
 
 
453 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  35.9 
 
 
574 aa  257  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  35.54 
 
 
443 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  39.68 
 
 
444 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.62 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.52 
 
 
584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  41.02 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.39 
 
 
616 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  39.82 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  39.82 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  40.27 
 
 
431 aa  253  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  36.5 
 
 
439 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  36.5 
 
 
439 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  36.5 
 
 
439 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.04 
 
 
460 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  35.9 
 
 
449 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  36.06 
 
 
439 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  36.28 
 
 
439 aa  247  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 
439 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  36.06 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  38 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  36.36 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.51 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  38.56 
 
 
444 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  38 
 
 
458 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0727  potassium uptake protein, TrkH family  42.55 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.157517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  35.25 
 
 
439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.75 
 
 
442 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  41.9 
 
 
443 aa  240  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4041  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.56 
 
 
709 aa  239  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.707053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  41.06 
 
 
443 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  40 
 
 
444 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>