225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0397 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  100 
 
 		 443 aa  863    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  55.91 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.58 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  56.06 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.41 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.68 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.39 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.75 
 
 		 444 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.57 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.42 
 
 		 444 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  48.95 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.5 
 
 		 446 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.55 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  50.11 
 
 		 464 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  46.35 
 
 		 458 aa  338  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.59 
 
 		 479 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.18 
 
 		 449 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  46.03 
 
 		 431 aa  333  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  47.14 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.88 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  41.97 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.82 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.62 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.19 
 
 		 450 aa  315  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  43.51 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.81 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.79 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.76 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.09 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  40.55 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  41.32 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  40.86 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  40.13 
 
 		 443 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  40.44 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  38.15 
 
 		 445 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  40.86 
 
 		 444 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  42.11 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  38.31 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  38.08 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  37.87 
 
 		 446 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  41.19 
 
 		 491 aa  259  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  37.89 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  38.01 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  38.01 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  36.28 
 
 		 447 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.59 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  42.32 
 
 		 447 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  38.68 
 
 		 454 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  38.68 
 
 		 454 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  37.94 
 
 		 453 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  38.68 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  38.37 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  35.93 
 
 		 451 aa  242  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0795  Trk-type K+ transport systems membrane component  35.21 
 
 		 488 aa  242  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.937253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.14 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.81 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  34.62 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  34.62 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  34.85 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  36.76 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  34.62 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  35.25 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  34.85 
 
 		 447 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  34.62 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  34.62 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  34.62 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  34.62 
 
 		 447 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  37.64 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  34.85 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  36.18 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.75 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.18 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  36.12 
 
 		 586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  35.21 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.88 
 
 		 633 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  35.37 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  35.37 
 
 		 454 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  35.9 
 
 		 586 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  37.02 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  38.79 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  34.97 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.88 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  33.48 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.32 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  35.59 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  35.15 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  36.79 
 
 		 444 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  34.99 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.77 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  34.79 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  35 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  38.22 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  41.01 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  35.71 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1045  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.86 
 
 		 449 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  34.55 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  34.16 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  34.83 
 
 		 574 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 		 443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>