90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3019 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 180 aa  373  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.28 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  41.67 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  41.86 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4122  hypothetical protein  42.5 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0992  hypothetical protein  38.99 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.11 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124478  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  32.33 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0615  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.09 
 
 		 309 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.05 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3062  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0224113  normal  0.0364236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 137 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 139 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5488  Glyoxalase/bleomycin resistance  28.68 
 
 		 315 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.181906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1978  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1893  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0412057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.97 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.81 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0104076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5337  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5628  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615046  normal  0.490927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2391  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.49 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5249  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3197  glyoxalase family protein  29.1 
 
 		 313 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0408011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2053  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.573082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 		 324 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0662478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.74 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.43 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6725  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6490  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 		 310 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.603238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  31.61 
 
 		 309 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1113  putative dioxygenase  26.8 
 
 		 309 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1985  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1934  glyoxalase  28.03 
 
 		 317 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  31.25 
 
 		 137 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.43 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.65 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 		 126 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.24 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  29.77 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2353  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.6 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000314642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.38 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  36.26 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0961  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 		 324 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.24 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  27.64 
 
 		 126 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  30.47 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1117  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.9 
 
 		 229 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 		 155 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0454  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 		 282 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  24.73 
 
 		 327 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.37 
 
 		 320 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0439701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  26.4 
 
 		 335 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 317 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0668  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.81 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3698  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 		 305 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4830  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 		 317 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2352  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0322563  hitchhiker  0.00507889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.36 
 
 		 306 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.93 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>