94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1934 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1934  glyoxalase  100 
 
 
317 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154277  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.99 
 
 
317 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4830  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.16 
 
 
317 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3197  glyoxalase family protein  56.21 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0408011  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.92 
 
 
310 aa  350  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.603238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2391  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.05 
 
 
319 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5488  Glyoxalase/bleomycin resistance  51.64 
 
 
315 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.181906  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1564  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.56 
 
 
304 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.6 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.07 
 
 
320 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0439701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.92 
 
 
320 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384782 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
320 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0155074  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.92 
 
 
320 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0496661  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4700  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
320 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0184772  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3667  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
320 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.789956  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1114  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
320 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.118393  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1492  glyoxalase family protein  33.68 
 
 
321 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  33.33 
 
 
321 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1327  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0981  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1243  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1316  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0586  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0310  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0961  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.68 
 
 
324 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0184  glyoxalase family protein  32.64 
 
 
321 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.92 
 
 
320 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207462  normal  0.0759343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.92 
 
 
320 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7068  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.94 
 
 
321 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0884954  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.65 
 
 
321 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3684  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
319 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.65 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0662478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3164  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.19 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1563  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3418  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.23 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0135  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
314 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2311  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.54 
 
 
334 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3427  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.72 
 
 
362 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.631827  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3429  hypothetical protein  29.05 
 
 
340 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0615  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1133  catechol 2,3-dioxygenase  34.4 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.53 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4677  catechol 2,3-dioxygenase  35.48 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0821  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.17 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2689  transcriptional regulator-like protein  34.51 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1113  putative dioxygenase  31.58 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5318  oxidoreductase  29.88 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  27.6 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6234  catechol 2,3-dioxygenase  29.56 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.716815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.99 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0226  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.76 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  33.59 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
201 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2816  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.85 
 
 
390 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  31.62 
 
 
201 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10787  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
204 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5440  hypothetical protein  30.83 
 
 
279 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  29.32 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3000  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 
400 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2459  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.92 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280374  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10624  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0725292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  33.33 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0726  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.05 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.79 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259566  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3527  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.94 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10883  oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06950)  37.5 
 
 
355 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.61156 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1191  2,3-dihydroxybiphenyl-1,2-dioxygenase  27.3 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42588  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.11 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4908  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.7 
 
 
377 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.35 
 
 
292 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590632  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  27.5 
 
 
177 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5775  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626114  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5085  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  24.67 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
180 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4403  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
165 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.84 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5806  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.87 
 
 
356 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000115423  hitchhiker  0.00371923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3532  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.09 
 
 
356 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>