51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2352 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2352  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 140 aa  291  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0322563  hitchhiker  0.00507889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3264  putative ring-cleaving dioxygenase  80 
 
 		 140 aa  240  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38340  putative ring-cleaving dioxygenase  79.86 
 
 		 140 aa  240  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0134299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25000  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/dioxygenase domain protein  76.43 
 
 		 142 aa  234  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.72 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2697  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1576  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1291  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000859167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2440  putative ring-cleaving dioxygenase  38.58 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200594  hitchhiker  0.00173848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2888  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0714585  normal  0.187507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.37 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294539  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0998  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2479  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3077  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2388  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0071702  normal  0.210559 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 		 211 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1628  glyoxalase family protein  29.59 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.294327 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1771  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  29.51 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.154627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1877  glyoxylase family protein  24.09 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.17 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  27.61 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0184  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.63 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.655327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3689  glyoxalase family protein  28.57 
 
 		 112 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0671782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.56 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  28.46 
 
 		 324 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  29.51 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2577  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0803  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.87 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0487  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2353  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000314642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3596  hypothetical protein  29.59 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3152  glyoxylase family protein  23.36 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607503  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3138  glyoxylase family protein (lactoylglutathione lyase)  23.36 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.181505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3046  glyoxylase family protein (lactoylglutathione lyase)  23.36 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3399  glyoxylase family protein  23.36 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6337  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3374  glyoxylase family protein  23.36 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1827  ring-cleaving dioxygenase  25.56 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.73 
 
 		 183 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>