57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5718 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.28 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  37.64 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0992  hypothetical protein  40.11 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4122  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  34.32 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.84 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124478  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  32.06 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 309 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.35 
 
 		 288 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3264  putative ring-cleaving dioxygenase  26.72 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.88 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2378  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 318 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2080  glyoxalase family protein  27.19 
 
 		 286 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38340  putative ring-cleaving dioxygenase  25.95 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0134299 
 
 
-
 
NC_004310  BR0848  glyoxalase family protein  23.81 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.19 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  27.56 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0840  glyoxalase family protein  23.81 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.80853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.95239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.19 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0104076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5337  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 		 172 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5249  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 		 172 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5628  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 		 172 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615046  normal  0.490927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  24.37 
 
 		 128 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  23.53 
 
 		 297 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  23.53 
 
 		 132 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2083  glyoxalase family protein  25.42 
 
 		 265 aa  41.6  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 303 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  26.77 
 
 		 137 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 299 aa  40.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.986343  hitchhiker  0.00000540832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>