54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_38340  putative ring-cleaving dioxygenase  100 
 
 
140 aa  290  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0134299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3264  putative ring-cleaving dioxygenase  99.28 
 
 
140 aa  285  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2352  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.86 
 
 
140 aa  240  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0322563  hitchhiker  0.00507889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25000  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/dioxygenase domain protein  75.18 
 
 
142 aa  226  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.77 
 
 
142 aa  188  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1576  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.72 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2440  putative ring-cleaving dioxygenase  37.01 
 
 
150 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200594  hitchhiker  0.00173848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2697  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1291  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000859167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.22 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294539  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2888  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0714585  normal  0.187507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  32.79 
 
 
166 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0998  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
211 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
128 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2479  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  29.85 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0490  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0508  ring-cleaving dioxygenase  31.34 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319055  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1771  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  31.15 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.154627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1827  ring-cleaving dioxygenase  27.82 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
160 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.52 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00157513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0487  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  30.43 
 
 
339 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1557  hypothetical protein  33.71 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0324701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2388  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.37 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1242  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
126 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.991894  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
164 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0624  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0010  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2353  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000314642  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.43 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.87 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0071702  normal  0.210559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6337  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.59 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4884  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>