58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3264 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3264  putative ring-cleaving dioxygenase  100 
 
 
140 aa  289  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38340  putative ring-cleaving dioxygenase  99.28 
 
 
140 aa  285  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0134299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2352  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  80 
 
 
140 aa  240  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0322563  hitchhiker  0.00507889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25000  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/dioxygenase domain protein  74.29 
 
 
142 aa  226  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.43 
 
 
142 aa  187  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2440  putative ring-cleaving dioxygenase  37.21 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200594  hitchhiker  0.00173848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1576  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.72 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2697  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.98 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294539  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1291  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000859167  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2888  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0714585  normal  0.187507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  31.97 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1771  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  31.97 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.154627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
183 aa  48.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0998  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
127 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2479  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0508  ring-cleaving dioxygenase  31.34 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319055  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0490  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1242  hypothetical protein  32.03 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  29.85 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.991894  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
165 aa  43.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1827  ring-cleaving dioxygenase  27.82 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.52 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1557  hypothetical protein  33.71 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0324701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4884  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
148 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2388  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  30.43 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00157513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0487  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
136 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0317  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.01 
 
 
127 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0910  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 
245 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0624  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
139 aa  40.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.619128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.43 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0010  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.77 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
265 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.112579  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2353  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000314642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.77 
 
 
165 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>