50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1252 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1252  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  31.37 
 
 
320 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  30.23 
 
 
314 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  29.04 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  30.87 
 
 
341 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  29.43 
 
 
346 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  29.12 
 
 
347 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1912  sulfotransferase  27.15 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275362  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  23.19 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  29.9 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1774  sulfotransferase domain-containing protein  29.09 
 
 
358 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2675  sulfotransferase  35 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.383164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2328  sulfotransferase  26.7 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195926  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  36.94 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.88 
 
 
725 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  25.37 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.34 
 
 
2762 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  27.83 
 
 
700 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  27.35 
 
 
3045 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.57 
 
 
648 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  21.28 
 
 
1470 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  24.79 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  21.28 
 
 
1470 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  25.11 
 
 
358 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  25.57 
 
 
637 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0203  hypothetical protein  37.96 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  31.25 
 
 
370 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23 
 
 
1764 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  24.64 
 
 
673 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4007  hypothetical protein  32.51 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0246  sulfotransferase  25.78 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00106726  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.59 
 
 
695 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  20 
 
 
531 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2617  hypothetical protein  31 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2761  sulfotransferase domain-containing protein  31 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  20.48 
 
 
889 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1026  sulfotransferase domain-containing protein  31 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 
899 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0179  sulfotransferase domain-containing protein  31 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25581  hypothetical protein  58.82 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1323  sulfotransferase domain-containing protein  31 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0154  sulfotransferase domain-containing protein  31 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  27.56 
 
 
368 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  24.51 
 
 
670 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
697 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2244  sulfotransferase  25.57 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00315501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0295  sulfotransferase  23.51 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0295  sulfotransferase  23.51 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.89 
 
 
762 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.89 
 
 
762 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>