18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4007 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4007  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  25.57 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  32.47 
 
 
370 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  30.43 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.81 
 
 
1764 aa  52  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1252  hypothetical protein  32.7 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  23.56 
 
 
320 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0415  hypothetical protein  19.91 
 
 
329 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  0.689465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  25.11 
 
 
336 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.84 
 
 
762 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.84 
 
 
762 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  25.45 
 
 
670 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  23.87 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1656  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  24.88 
 
 
281 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  26.98 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  26.07 
 
 
637 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  27.01 
 
 
488 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>