54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4606 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4606  Viomycin kinase  100 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0226508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  23.18 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  22.73 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.65 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1228  aminoglycoside phosphotransferase  32.96 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5382  hypothetical protein  31.28 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0231143  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3913  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.01 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  22.92 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  23.14 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.92 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.92 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.92 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1431  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.43 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.27 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1102  aminoglycoside phosphotransferase  21.05 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2829  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.077246  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15080  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  21.76 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 
365 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1301  aminoglycoside phosphotransferase  21.56 
 
 
302 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6439  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.562376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  37.86 
 
 
426 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  44.9 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19180  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209047  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5681  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
306 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  26.51 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  28.29 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0713  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
455 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2755  aminoglycoside phosphotransferase  40.91 
 
 
401 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133804  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1801  hypothetical protein  31.87 
 
 
220 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00869097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 
354 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  45.07 
 
 
334 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
351 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  43.64 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  43.66 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  23.44 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  22.4 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  26.4 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  26.34 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  43.66 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  38.82 
 
 
450 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  27.32 
 
 
367 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  27.32 
 
 
366 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  27.32 
 
 
366 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4570  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
362 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303984  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2608  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 
326 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 
475 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>