19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1228 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1228  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
294 aa  564  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5382  hypothetical protein  49.43 
 
 
287 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0231143  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06010  hypothetical protein  33.44 
 
 
358 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.511402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4606  Viomycin kinase  32.96 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0226508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  36.46 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
297 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
386 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  34.93 
 
 
339 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  28.07 
 
 
346 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  28.5 
 
 
354 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 
346 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2613  Hygromycin-B kinase  38.57 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6439  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.562376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4789  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like  40.82 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.92 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3665  aminoglycoside phosphotransferase  44.83 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0375  hypothetical protein  26.53 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>