110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3568 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  88.86 
 
 		 350 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 349 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 		 350 aa  643    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  75.43 
 
 		 350 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  70.2 
 
 		 349 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  67.61 
 
 		 360 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  67.24 
 
 		 355 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  66.19 
 
 		 360 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  65.99 
 
 		 349 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  65.91 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  62.57 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  64.84 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  63.35 
 
 		 359 aa  471  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  63.32 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  62.78 
 
 		 357 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  63.64 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  60.34 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  36.3 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  34.22 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  34.21 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  34.21 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  33.55 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  35.2 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  31.11 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  31.63 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  33.13 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  31.95 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  31.27 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  34.14 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  34.33 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  33.68 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  33.79 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  28.87 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.67 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  25.31 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  28.01 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  26.15 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  28.57 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  33.67 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  26.41 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  27.24 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  29.41 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  26.63 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  28.74 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  25.95 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  25.93 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  26.48 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  25.87 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  32.07 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  25.68 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.33 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  30.11 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  25.89 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  28.26 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  30.05 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  25.76 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  30.34 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  30.34 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  26.57 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  25.29 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  24.15 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.19 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  23.17 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  27.13 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  26.46 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  23.74 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  25.43 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  25.11 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  24.17 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.29 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  26.59 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  22.99 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  20.99 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  25.71 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  25.37 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  22.91 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  23.79 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  22.66 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  25.43 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  25.73 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  32.03 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  24.46 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  21.59 
 
 		 272 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  22.9 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  24.79 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  21.21 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  21.21 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  22.34 
 
 		 253 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  25.29 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>