119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2509 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  66.67 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  67.32 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  61.39 
 
 		 299 aa  397  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  64.9 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  64.9 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  63.91 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  61.89 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  61.89 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  61.89 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  62.34 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  60.6 
 
 		 307 aa  363  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  55.3 
 
 		 300 aa  349  4e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  55.12 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  52.65 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  34.65 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  36.63 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  34.32 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  35.16 
 
 		 359 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  34.64 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  33.55 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  34.81 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  31.95 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  32.13 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  33.22 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  33.75 
 
 		 355 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  35.35 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  31.94 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  33.88 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  33.66 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  35.21 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  33.87 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  31.86 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  34.38 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.24 
 
 		 266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  33.73 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  32.46 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  30.15 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  30.57 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  30.11 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  27.96 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  28.9 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  29.41 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  28.21 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  31.65 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  29.67 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  25.37 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  27.94 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  26.37 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  31.05 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  27.24 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  28.04 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  24.63 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  28.57 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  25.46 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  25.64 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  26.19 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  30.18 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  30.18 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.67 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  23.42 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  28.19 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  25.95 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  24.56 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  25.54 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.57 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  23.9 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  25.69 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  24.3 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  24.3 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.9 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  26.84 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  26.18 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  25.88 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  25.19 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  21.99 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  26.63 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  24.81 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  23.08 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  28.21 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  24.56 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  24.64 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  26.09 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  24.51 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  29.07 
 
 		 253 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  25.69 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  25.1 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  26.06 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  20.32 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>