124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1112 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  65.35 
 
 
309 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  65.35 
 
 
309 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  65.35 
 
 
309 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  61.89 
 
 
304 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  65.79 
 
 
309 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  60.6 
 
 
310 aa  363  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  59.09 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  59.74 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  59.74 
 
 
309 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  59.42 
 
 
309 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  54.75 
 
 
300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  56.11 
 
 
299 aa  337  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 
301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  49.5 
 
 
318 aa  281  7.000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
350 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  36 
 
 
350 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  38.21 
 
 
350 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  35.26 
 
 
360 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  36.3 
 
 
349 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  37.37 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  36.96 
 
 
356 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  36.03 
 
 
352 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  36.51 
 
 
349 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  34.29 
 
 
356 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  35.05 
 
 
360 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
359 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  36.08 
 
 
356 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  34.95 
 
 
357 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  37.04 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  35.08 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  36.45 
 
 
355 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  35.55 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  36.7 
 
 
349 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  34.57 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.6 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  35.86 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  34.93 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  35.04 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  31.16 
 
 
308 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  32.45 
 
 
260 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  29.71 
 
 
308 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  29.35 
 
 
308 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  28.42 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  32.14 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  29.39 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  28.62 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  28.99 
 
 
300 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  28.36 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  28.99 
 
 
304 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  28.78 
 
 
313 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  30.22 
 
 
312 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  28.52 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  27.27 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  26.81 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  30.94 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  30.94 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.05 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  24.03 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  30.35 
 
 
262 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  28.24 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  24.67 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  25.59 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  25.46 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  25.79 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  27.17 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  26.62 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  25.97 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  26.34 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.62 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  25.9 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  25.9 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  24.32 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  26.1 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  25.5 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  25.19 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  23.53 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  27.04 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  24.9 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  24.19 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  24.9 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.59 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  24.43 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  23.6 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  23.97 
 
 
285 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  25.41 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  25.38 
 
 
265 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  23.05 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  28.74 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  26.74 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  24.34 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>