144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0176 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  100 
 
 
307 aa  636    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  80.81 
 
 
304 aa  528  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  68.79 
 
 
297 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  70 
 
 
307 aa  447  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  69.59 
 
 
302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  68.09 
 
 
304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  67.89 
 
 
308 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  66.44 
 
 
300 aa  429  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  63.79 
 
 
308 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  63.46 
 
 
308 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  62.13 
 
 
308 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  65.89 
 
 
307 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  58.31 
 
 
312 aa  368  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  59.09 
 
 
313 aa  363  2e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  58.25 
 
 
313 aa  362  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  55.37 
 
 
300 aa  347  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  56.46 
 
 
306 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  56.46 
 
 
306 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.56 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  34.67 
 
 
264 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  35.04 
 
 
262 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  32.18 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  32.34 
 
 
264 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  32.34 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  30.74 
 
 
299 aa  102  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  29.35 
 
 
318 aa  92.8  6e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  27.97 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  25.81 
 
 
304 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  32.93 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  27.24 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  25.72 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  27.96 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  32.32 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  28.44 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  26.46 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  25.87 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  27.6 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  26.81 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  25 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  31.1 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  27.94 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  27.6 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  26.28 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  30.77 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  27.36 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  36.02 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  25.52 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  25.17 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  25.86 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  29.56 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  26.32 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  30.29 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  24.74 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  24.4 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  28.37 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  24.21 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.4 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  29.28 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  25.25 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  31.29 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  23.7 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  27.57 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  32.21 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  34.33 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  30.99 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  26.26 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  25.95 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  23.55 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  24.22 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  29.81 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.15 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  25.9 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  29.15 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  31.39 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.59 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  27.57 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  25.9 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  28.44 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  25.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  37.23 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.6 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  28.19 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  26 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  27.23 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  28.11 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  30.67 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  26.53 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  32.72 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>