130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1920 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  87.7 
 
 		 309 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  87.38 
 
 		 309 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  86.08 
 
 		 309 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  67.32 
 
 		 310 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  63.11 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  60.86 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  60.86 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  60.86 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  59.41 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  59.42 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  55.08 
 
 		 301 aa  345  7e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  54.43 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  47 
 
 		 318 aa  292  5e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  36.72 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  37.17 
 
 		 349 aa  165  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  34.39 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  33.12 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  34.18 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  34.33 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  36.45 
 
 		 356 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  35.81 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  34.38 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  33.44 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  34.1 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  33.75 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  33.54 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  34.92 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  33.12 
 
 		 359 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  32.38 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  32.8 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  32.59 
 
 		 351 aa  148  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  34.57 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  31 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.95 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  28.95 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  29.17 
 
 		 264 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  27.99 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  29.35 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  27.86 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  26.52 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  26.43 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  25.44 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  26.62 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  28.52 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  27.18 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  24.64 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  25.27 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  24.91 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  25.8 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  30.89 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  30.89 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  26.5 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  26.3 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  25.45 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  22.78 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  24.2 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  25.69 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  24.41 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  23.46 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.27 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  24.42 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  24.71 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  24.24 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  24.8 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  22.85 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  26.55 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  26.86 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.64 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  21.98 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.59 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  24.02 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  21.98 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  24.51 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  21.69 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  23.16 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  23.23 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  26.55 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  24.62 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  30.83 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  22.52 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  23.72 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  27.37 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  23.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  23.53 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  23.81 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  25.13 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  23.4 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  23.4 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>