21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0782 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  94.81 
 
 
231 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  70.13 
 
 
231 aa  346  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  64.47 
 
 
255 aa  305  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  67.53 
 
 
242 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  54.98 
 
 
231 aa  263  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  54.82 
 
 
231 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  54.71 
 
 
228 aa  248  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  51.09 
 
 
234 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  44.95 
 
 
227 aa  198  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  43.53 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  43.1 
 
 
233 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  44.95 
 
 
232 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.96 
 
 
252 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  42.67 
 
 
233 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  38.07 
 
 
233 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  30.21 
 
 
267 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  28.79 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  26.9 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  26 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  24 
 
 
213 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>