17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01333 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  74.24 
 
 		 232 aa  349  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  70.67 
 
 		 233 aa  327  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  70.22 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  48.44 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.75 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  44.02 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  41.15 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  39.57 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  42.79 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  40.61 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  40.55 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  41.85 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  38.07 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  28.28 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>