17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0333 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
252 aa  224  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  48.44 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  47.35 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  48.62 
 
 
231 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  47.53 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  47.53 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  46.51 
 
 
255 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  47.79 
 
 
231 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  44 
 
 
234 aa  204  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  45 
 
 
231 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  46.01 
 
 
228 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  43.3 
 
 
234 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  47.47 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  44.5 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  44.95 
 
 
232 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  28.69 
 
 
267 aa  95.9  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>