18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0006 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  67.84 
 
 
231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  68.8 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  64.78 
 
 
231 aa  295  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  64.47 
 
 
232 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  57.96 
 
 
231 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  55.75 
 
 
231 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  56.11 
 
 
228 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  48.07 
 
 
234 aa  235  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.44 
 
 
252 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  47.19 
 
 
232 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  46.51 
 
 
227 aa  208  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  45.58 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  45.41 
 
 
233 aa  197  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  44.95 
 
 
233 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  40.61 
 
 
233 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  26.88 
 
 
267 aa  89  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  22.69 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>