17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1217 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  460  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  79.74 
 
 		 233 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  79.74 
 
 		 233 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  74.24 
 
 		 233 aa  349  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.22 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  47.35 
 
 		 227 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  47.19 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  44.84 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  44.4 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  42.61 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  46.54 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  43.33 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  46.33 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  44.95 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  27.82 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>