24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1717 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  224  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  44.35 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  49.78 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  50.22 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  49.34 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  46.75 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  44.74 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  47.19 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  43.05 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  44.64 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  40.81 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  39.74 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  40.69 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  41.67 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  38.96 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  29.39 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  21.02 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  21.12 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4417  hypothetical protein  26.55 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0610786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4131  hypothetical protein  24.46 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00913314  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  26.55 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  23 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  21.74 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>