38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2836 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  100 
 
 
213 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  91.55 
 
 
213 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  68.54 
 
 
240 aa  287  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1780  hypothetical protein  68.54 
 
 
213 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0332  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1370  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0966  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0229  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0413  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1865  hypothetical protein  67.61 
 
 
213 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.331271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  66.35 
 
 
219 aa  277  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4131  hypothetical protein  65.38 
 
 
284 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00913314  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  62.98 
 
 
218 aa  257  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4417  hypothetical protein  62.5 
 
 
218 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0610786  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  62.14 
 
 
221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3844  hypothetical protein  60 
 
 
218 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5780  hypothetical protein  59.52 
 
 
231 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279837  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4524  hypothetical protein  59.52 
 
 
223 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  52.38 
 
 
210 aa  198  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0243  hypothetical protein  52.48 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7125  hypothetical protein  49.5 
 
 
224 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0353961  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5341  hypothetical protein  47.57 
 
 
211 aa  171  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503759  normal  0.0287928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1855  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4363  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4253  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3985  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3975  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.892203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4311  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4345  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0895  hypothetical protein  18.27 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4135  hypothetical protein  18.82 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4455  hypothetical protein  18.82 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4087  hypothetical protein  17.79 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2920  hypothetical protein  18.82 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  21.12 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0192  hypothetical protein  25.49 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1912  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  26.85 
 
 
231 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>