35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3844 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3844  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5780  hypothetical protein  99.54 
 
 
231 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279837  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4524  hypothetical protein  99.54 
 
 
223 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  89.91 
 
 
221 aa  390  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4417  hypothetical protein  86.24 
 
 
218 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0610786  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  84.86 
 
 
218 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4131  hypothetical protein  81.57 
 
 
284 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00913314  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  60.95 
 
 
213 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  60 
 
 
213 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  56.87 
 
 
240 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0332  hypothetical protein  55.66 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1780  hypothetical protein  55.66 
 
 
213 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  58.79 
 
 
219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0966  hypothetical protein  55.19 
 
 
213 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1370  hypothetical protein  55.19 
 
 
213 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0229  hypothetical protein  55.19 
 
 
213 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0413  hypothetical protein  55.19 
 
 
213 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1865  hypothetical protein  55.19 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.331271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  47.18 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7125  hypothetical protein  42.65 
 
 
224 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0353961  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0243  hypothetical protein  43.13 
 
 
221 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5341  hypothetical protein  43.46 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503759  normal  0.0287928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1855  hypothetical protein  29.56 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4363  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4345  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0895  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3975  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.892203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4311  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4253  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4135  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4455  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3985  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4087  hypothetical protein  20.59 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2920  hypothetical protein  20 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1912  hypothetical protein  22.96 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>