18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1912 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1912  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1038  hypothetical protein  28.04 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  23.98 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0192  hypothetical protein  28.27 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3844  hypothetical protein  22.96 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4524  hypothetical protein  23.31 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5780  hypothetical protein  23.31 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279837  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1865  hypothetical protein  24.4 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.331271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1780  hypothetical protein  24.4 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  25 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0332  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0966  hypothetical protein  24.4 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0229  hypothetical protein  24.4 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1370  hypothetical protein  24.4 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0413  hypothetical protein  24.4 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  24.22 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  23.97 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  24.48 
 
 
210 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>