20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0192 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0192  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  27.42 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4417  hypothetical protein  26.34 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0610786  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1038  hypothetical protein  26.99 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3844  hypothetical protein  29.17 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4524  hypothetical protein  29.17 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5780  hypothetical protein  29.17 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279837  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4131  hypothetical protein  27 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00913314  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  26.74 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0332  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1370  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1780  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1865  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.331271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0229  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0413  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  26.37 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0966  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1912  hypothetical protein  28.27 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  26.32 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  25.49 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>