20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04748 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  90.48 
 
 
231 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  56.28 
 
 
231 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  60.18 
 
 
242 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  55.75 
 
 
255 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  54.11 
 
 
231 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  54.98 
 
 
232 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  52.61 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  55.11 
 
 
228 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  47.79 
 
 
227 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.05 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  44.93 
 
 
232 aa  194  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  44.2 
 
 
233 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 
233 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  41.13 
 
 
234 aa  191  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  43.75 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  30.08 
 
 
267 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  23.62 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  29.66 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  25.61 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>