18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0273 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  28.04 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  28.5 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  23.62 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  24.22 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  28.79 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  24.39 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  24.88 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  23.11 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  21.43 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  24.61 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  23.08 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  25.36 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  25 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  23.56 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>