22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0685 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  68.8 
 
 		 255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  66.96 
 
 		 231 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  67.53 
 
 		 232 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  66.96 
 
 		 231 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  60.18 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  58.85 
 
 		 231 aa  274  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  61.64 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.19 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  49.36 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  47.47 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  46.33 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  44.16 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  43.72 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  40.77 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  29.92 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  25.48 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2836  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0243  hypothetical protein  31.86 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1616  putative transmembrane protein  27.34 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1105  hypothetical protein  24.44 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>