19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2299 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  55.2 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  56.11 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  54.67 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  61.64 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  55.11 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  54.71 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  53.81 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  47.09 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  46.01 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  43.18 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  43.33 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  42.73 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.67 
 
 		 252 aa  181  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  41.63 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  40.55 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  30.43 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  29.51 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0765  hypothetical protein  25.5 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>