22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2727 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  69.26 
 
 
231 aa  329  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  70.13 
 
 
232 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  67.84 
 
 
255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  67.25 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  56.28 
 
 
231 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  55.07 
 
 
231 aa  271  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  55.2 
 
 
228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  50.66 
 
 
234 aa  234  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  48.62 
 
 
227 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 
252 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  44.83 
 
 
233 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  44.83 
 
 
233 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  44.4 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  40.97 
 
 
234 aa  185  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  42.79 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  27.91 
 
 
267 aa  98.6  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  28.5 
 
 
263 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0243  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7125  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0353961  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1323  hypothetical protein  23.39 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1746  putative transmembrane protein  33.02 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>